Surveillance hospitalière des pneumococcies invasives chez les jeunes enfants dans les zones urbaines du Népal

Contexte Streptococcus pneumoniae est une cause majeure de pneumonie et de méningite chez les jeunes enfants Avant la mise en place du vaccin antipneumococcique conjugué dans les pays en développement, il est urgent de fournir des données épidémiologiques régionales sur les pneumococcies. Les objectifs de cette étude étaient de déterminer la prévalence et le sérotype. Les enfants âgés de plusieurs mois à des années qui ont été admis à l’hôpital de Patan, Katmandou, avec fièvre et / ou suspicion de pneumonie, de méningite ou de bactériémie ont été recrutés. Des spécimens de culture de sang ont été prélevés chez tous les participants. Des échantillons de liquide céphalo-rachidien ont été cultivés et testés pour l’antigène S pneumoniae. Résultats Au total, des enfants ont été recrutés pendant la période d’étude de mois Parmi ceux-ci,% avaient une méningite et% une pneumonie, sur la base de critères cliniques. %, et Des sérotypes et A ont été isolés le plus fréquemment, et seuls des isolats présentaient un sérotype contenu dans le vaccin antipneumococcique conjugué actuellement disponible. Conclusions Plus de% des enfants âgés de ; Les syndromes cliniques de la méningite et / ou de la pneumonie ont été associés à une nouvelle génération de vaccins antipneumococciques qui préviennent l’infection par un éventail plus large de sérotypes, afin de lutter efficacement contre les infections pneumococciques. chez les jeunes enfants à Katmandou

La pneumonie est la principale cause de décès chez les enfants dans le monde, représentant% du million de décès d’enfants chaque année , et la majorité des cas surviennent dans les pays pauvres en ressources. Streptococcus pneumoniae est la cause la plus fréquente de pneumonie chez les nourrissons et les jeunes Depuis le développement du vaccin antipneumococcique conjugué, un effort mondial a été déployé pour fournir des données locales afin de planifier les stratégies de mise en œuvre des vaccins, sous la direction de l’Alliance GAVI pour le développement accéléré des vaccins antipneumococciques. et Introduction Plan PneumoADIP En, l’Organisation mondiale de la Santé a recommandé que le vaccin antipneumococcique conjugué soit une priorité à inclure dans les programmes nationaux de vaccination infantile . La surveillance active des pneumococcies évitables a été encouragée mais devrait être associée à l’identification des sérotypes. vaccin contre le pneumocoqueNepal, l’un des pays les plus pauvres du monde, a un taux de mortalité très élevé pour les enfants de moins de 18 ans; La pneumonie est l’une des principales causes de décès pour ce groupe d’âge Bien que l’importance de la pneumococcie ait été démontrée chez des adultes fébriles au Népal , il existe peu de données publiées sur l’étiologie des maladies graves. Infections bactériennes chez les enfants népalais Bien que des études aient identifié S pneumoniae comme cause de méningite infantile, l’épidémiologie locale de la maladie causée par cet organisme est inconnue. Au Népal, le vaccin antipneumococcique conjugué ne fait actuellement pas partie du programme élargi local de vaccination. Le vaccin est actuellement disponible sur le marché privé dans la plupart des pays en développement, seul un très petit nombre de familles sont en mesure de se le permettre, et au moment de l’étude, il n’était pas disponible au Népal. vaccins dans le monde et le Népal figure parmi les pays éligibles à l’aide financière de GAVI Alliance Accurate data conc Les syndromes cliniques de pneumonie et de méningite chez les enfants et l’épidémiologie locale des maladies provoquées par des infections évitables par la vaccination sont nécessaires pour aider les décideurs dans leurs décisions concernant la mise en œuvre locale du vaccin au Népal. Les objectifs de cette étude étaient de déterminer la prévalence de pneumococcie invasive chez les jeunes enfants hospitalisés dans les zones urbaines du Népal et pour décrire la distribution locale des sérotypes et les profils de sensibilité aux antibiotiques des isolats pneumococciques invasifs

Méthodes

L’établissement de l’hôpital de Patan compte seulement de grands hôpitaux dans la vallée de Kathmandu qui acceptent les références pédiatriques et qui ont des établissements pour patients hospitalisés en pédiatrie. Dans la vallée de Katmandou, la population totale était de ans L’autre hôpital pédiatrique Kanti Children’s Hospital admet ~ fois plus d’enfants que l’hôpital de Patan Par conséquent, la population estimée des enfants âgés de & lt; Bien que cette population soit principalement urbaine, les dossiers d’admission de l’hôpital de Patan ont montré que% des admissions provenaient de l’extérieur de la vallée, principalement des communautés rurales ayant un accès limité aux soins de santé. Népal est un pays à faible revenu où On estime qu’environ un tiers des personnes vivent en dessous du seuil de pauvreté L’accès aux soins diffère considérablement selon le milieu géographique et d’autres facteurs, mais seulement un quart des enfants âgés les années qui ont une pneumonie sont prises dans un établissement de santé La prévalence de la malnutrition chez les enfants est élevée; ~% Des enfants ont des mesures de taille et de poids inférieures aux valeurs attendues pour leur âge La séroprévalence des anticorps anti-VIH dans la population adulte est faible en% Aucune information n’est disponible pour la prévalence chez les enfants Population échantillon Tous les enfants âgés de – mois inclusivement qui ont été admis au service de pédiatrie à l’hôpital de Patan d’avril à décembre avec la température de fièvre, ⩾ ° C et / ou un diagnostic clinique possible de méningite, de pneumonie ou de septicémie ont été considérés pour entrer dans l’étude. Critères d’exclusion: absence d’échantillons d’hémocultures prélevés à l’admission, hospitalisation pour toute maladie au cours des jours précédents et présentation avec respiration sifflante récidivante ou gastro-entérite aiguë seule Méthodes de laboratoire les numérations globulaires ont été réalisées et la culture de sang sp Des échantillons de sang ont été prélevés avant l’administration d’antibiotiques, dans la mesure du possible. La grande majorité des échantillons d’hémoculture ont été recueillis dans des flacons d’hémoculture préparés commercialement BACTEC Peds Plus / F; Becton Dickinson, mais certains patients ont été admis après avoir prélevé un échantillon d’hémoculture en utilisant des flacons de culture préparés localement. Les ponctions lombaires ont été effectuées à la discrétion du clinicien. Cependant, la pratique de routine à l’hôpital de Patan consiste à pratiquer des ponctions lombaires pour tous les enfants. suspicion de méningite, à moins que l’enfant ne soit médicalement instable ou qu’il y ait une augmentation de la pression intracrânienne caustique. Les patients de l’étude ont reçu des soins médicaux standard de l’équipe pédiatrique de l’hôpital.Les flacons de culture ont été incubés à ° C et vérifiés deux fois par jour. turbidité, at-h et jours d’incubation Les échantillons de CSF ont été directement étalés sur du sang de mouton et de la gélose au chocolat et ont été incubés à ° C dans un environnement enrichi en dioxyde de carbone pour un échantillon de WBC & gt; cellules / mm, puis un test immunochromatographique de l’antigène pneumococcique NOW Streptococcus pneumoniae Antigen Test; Binax a été réalisée Des échantillons d’autres sites stériles ont été cultivés selon la pratique hospitalière de routine. Isolement et identification de S pneumoniae à l’aide de tests microbiologiques standard Tous les isolats S pneumoniae ont été envoyés au laboratoire de microbiologie du Christian Medical College Vellore en Inde pour confirmation, sérotypage, Tests de sensibilité aux antibiotiques par détermination de la CMI Le sérotypage a été effectué selon des méthodes établies et les lignes directrices du Clinical and Laboratory Standards Institute ont été utilisées pour les tests de sensibilité aux antibiotiques Définitions des cas Les définitions des syndromes cliniques et des diagnostics finaux sont présentées dans le tableau. selon les critères établis par les investigateurs de PneumoADIP, voir l’annexe dans ce supplément, avec des modifications mineures pour les données recueillies dans notre population. Les résultats de la radiographie thoracique ont été rapportés par l’équipe clinique locale ou les radiologistes. les derniers mois de l’étude

Tableau Voir largeDownload slideDefinitions des syndromes cliniques, le diagnostic final, et des modifications de PneumoADIP definitionsTable Voir largeDownload slideDefinitions des syndromes cliniques, le diagnostic final et les modifications de PneumoADIP approbation definitionsEthics approbation éthique a été obtenu à partir de Comité d’éthique de la recherche tropicale d’Oxford OXTREC – et le Conseil de recherche en santé au Népal

Résultats

Au cours de la période d’étude de mois, les patients ont été admis dans le service de pédiatrie de l’hôpital de Patan. Parmi ceux-ci,% étaient éligibles au recrutement et parmi les éligibles,% ont été recrutés pour l’inclusion dans l’étude. Les échantillons de culture sanguine ont été prélevés chez tous les enfants, des échantillons de LCR ont été prélevés chez des enfants et des échantillons de culture provenant d’autres sites stériles ont été prélevés sur des enfants pleuraux, sous-duraux. empyèmes et autres échantillons de pus La tranche d’âge des enfants recrutés était de & mois; ans âge médian, mois; % étaient âgés & lt; mois, et% étaient âgés & lt; mois, et% étaient des hommes avec un score de poids pour l’âge z de – Epi Info, version; Centres de contrôle et de prévention des maladies,% des enfants pour lesquels les données disponibles étaient en insuffisance pondérale Sur la base du rapport parental,% des enfants avaient reçu un traitement antibiotique avant l’admission syndromes cliniques et les diagnostics Les syndromes cliniques et les diagnostics finaux sont répertoriés dans le tableau Parmi les patients,% avaient un syndrome clinique de la méningite, dont% avaient un diagnostic définitif de méningite définie ou probable avec l’utilisation des critères définis De noter,% du diagnostic final de méningite probable ou définie ont été manqués par le syndrome clinique de la méningite critères, principalement parce qu’ils avaient une histoire de fièvre durable & gt; Le syndrome clinique de pneumonie était plus fréquent, avec% de patients présentant une tachypnée. Parmi les échantillons de LCR obtenus,% étaient purulents avec un nombre de globules blancs mm cellules / mm Les résultats positifs de radiographie thoracique ont été confirmés pour% des patients atteints de pneumonie. toute la population étudiée des enfants Bien que cette constatation ait été plus fréquente que celle de la méningite probable ou définitive, un agent pathogène a été retrouvé plus fréquemment chez les patients atteints de méningite que chez les patients ayant une pneumonie radiographiquement confirmée% vs%

Tableau View largeDownload slideNombre de cas causés par divers organismes, avec utilisation de définitions de cas standardTable View largeDownload slideNombre de cas causés par divers organismes, avec l’utilisation de définitions de cas standardMicrobio pneumococcie confirmée Tableau montre les résultats des enquêtes microbiologiques selon le type d’échantillon ,% avaient des hémocultures positives pour un organisme pathogène; % des cultures étaient positives pour S pneumoniae Parmi les échantillons de CSF cultivés,% ont donné un organisme pathogène, dont% étaient positifs pour S pneumoniae L’échantillon CSF de l’enfant était négatif à la culture mais avait des résultats positifs au test immunochromatographique et S pneumoniae a été isolée de l’hémoculture Aucun autre cas de méningite à pneumocoques n’a été identifié par le seul test immunochromatographique de l’antigène, qui a été réalisé sur% des échantillons de LCR

Tableau View largeTélécharger diapositivePathogen identification, stratifié par méthode d’identificationTable View largeTélécharger slidePathogen identification, stratifié par méthode d’identificationParmi les enfants atteints de pneumococcie confirmée par la culture, il y avait une répartition presque égale des sexes femelles et mâles La majorité des enfants atteints de pneumococcie confirmée étaient âgés & lt; Sur la base des données du recensement pour la vallée de Katmandou et d’autres hypothèses, à savoir un pourcentage estimé de patients provenant de l’extérieur de la vallée, et le pourcentage de patients éligibles recrutés, le taux d’incidence annuel brut estimé de pneumococcie confirmée était de enfants âgés de & lt; années

Figure Vue largeTélécharger slideAge distribution chez les enfants atteints de pneumococcie invasive confirmée IPDFigure View largeDownload distribution chez les enfants atteints de pneumococcie invasive confirmée IPDTels enfants ayant participé à cette étude sont décédés pendant leur séjour à l’hôpital L’un d’entre eux avait une méningite à pneumocoque confirmée; Aucun des autres n’a identifié d’organisme pathologique. Les sérotypes les plus communs identifiés étaient: A Tous les isolats étaient sensibles à la pénicilline, alors que seulement% étaient sensibles à la triméthoprime-sulfaméthoxazole. Cotrimoxazole

Figure Vue largeDownload slideDistribution des sérotypes identifiés et le pourcentage de sérotypes couverts par PCV -valent, PCV valide, et -vaccin conjugué anti-pneumococcique valvulaire PCV NT, non typableFigure View largeDownload slideDistribution des sérotypes identifiés et le pourcentage de sérotypes couverts par -VPV -valent , -VPC-valent, et -Vaccin conjugué antipneumococcique-PCV valide NT, non typable

Figure View largeTélécharger Diagrammes de sensibilité aux antibiotiques des isolats pneumococciquesFigure View largeTélécharger Diagrammes de susceptibilité aux antibiotiques des isolats pneumococciques

Discussion

Les patients présentant des modifications radiographiques pulmonaires compatibles avec la pneumonie ne remplissaient pas les critères du syndrome clinique de pneumonie parce qu’ils n’avaient pas de tachypnée et que% des diagnostics de méningite probables ou définitifs n’étaient pas identifiés par la définition syndromique de la méningite car les patients n’étaient pas fébriles. la maladie est survenue relativement rarement% des admissions, mais% des patients avec une maladie très sévère avaient une bactériémie confirmée La ponction lombaire n’était pas incluse comme critère unique pour une maladie très grave car il y avait un seuil bas pour cette investigation dans notre étude. enfants% des admissions auraient été classées dans cette catégorie selon ce seul critère si elle avait été incluse Malgré le fait que les enfants% aient été admis avec une méningite, une pneumonie très sévère, ou une maladie très sévère, seulement% des enfants sont décédés. enfants hospitalisés avec une septicémie soupçonnée présentée la nuit ou extremis, certains enfants sont morts avant le recrutement; Bien que seul un enfant décédé ait eu un diagnostic microbiologique de S pneumoniae, la majorité des enfants décédés avaient un diagnostic d’étude de méningite ou de pneumonie pouvant refléter une infection pneumococcique. Les études sur l’utilisation du vaccin conjugué contre le pneumocoque montrent un% – % réduction du nombre de cas de pneumonie radiographiquement confirmée dans divers contextes De telles études montrent une plus grande réduction de l’incidence de la maladie définie par des critères cliniques tels que les signes cliniques ou radiographiques de pneumonie que par l’incidence de maladie confirmée par culture. étude, bien que seulement un% des cas de pneumonie confirmée radiographiquement ait eu une hémoculture positive pour S pneumoniae, les données d’un essai d’intervention pneumococcique en Gambie suggèrent que la prévalence réelle de la pneumonie causée par le pneumocoque est susceptible d’être au moins plus élevée Nos taux signalés de pneumococcie positive pour la culture sont également probables une sous-estimation des taux réels à Katmandou, compte tenu du taux élevé d’utilisation d’antibiotiques préhospitaliers. La majorité des isolements pneumococciques dans cette étude étaient des sérotypes et A. Aucun de ces vaccins n’est couvert par le vaccin antipneumococcique valent actuellement disponible. % des sérotypes identifiés dans cette étude Les nouveaux vaccins en cours de développement offrent une couverture plus large, mais même le vaccin -valent en développement avancé couvrirait juste au-dessus% des sérotypes de pneumocoques isolés à l’hôpital de Patan pendant la période d’étude. La couverture vaccinale des sérotypes de S pneumoniae est beaucoup plus faible que celle des études en Afrique [,,] Cependant, notre population d’isolats est actuellement faible et sera combinée avec d’autres données locales pour la détermination de la politique vaccinale dans la région. le taux élevé d’utilisation d’antibiotiques préhospitaliers peut avoir influencé de manière sélective la distribution du sérotype des isolats cultivés. Le petit nombre d’isolats de S pneumoniae testés pour la sensibilité aux antibiotiques était entièrement sensible à la pénicilline, alors que seulement la moitié était sensible au cotrimoxazole, un traitement antibiotique de première intention contre la pneumonie infantile au Népal. Ce schéma est similaire à la sensibilité aux antibiotiques profil du pneumocoque retrouvé au Kanti Children’s Hospital et reflète une tendance à l’augmentation de la résistance aux antimicrobiens signalée dans d’autres études asiatiques L’utilisation du cotrimoxazole comme traitement antibiotique de première intention contre la pneumonie dans ce contexte devrait être reconsidérée. En conséquence, nous avons presque certainement sous-estimé l’incidence des pneumococcies dans cette population. Nous avons étudié une population hospitalisée en milieu urbain. la population du Népal vit dans les zones urbaines , et l’épidémiologie du pneumonie la maladie ococcique peut être différente dans les zones rurales reculées du pays L’incidence de la pneumonie est susceptible d’être plus élevée chez les enfants dans les zones rurales du Népal; chez les enfants âgés de & lt; années, on estime que% -% des décès sont dus à la pneumonie, et le taux annuel prévu de cas de pneumonie est calculé pour être% de la population Cette étude et l’autre étude contemporaine à Kanti Children’s Hospital ont clairement montré que Bien que la taille de notre échantillon soit limitée, les sérotypes des souches pneumococciques isolées diffèrent considérablement de ceux du vaccin antipneumococcique conjugué actuel actuellement disponible. Si cette observation est limitée, les pneumonies, les méningites et les pneumococcies est confirmée dans des études de plus grande envergure, une nouvelle génération de vaccins antipneumococciques de plus haute valence peut être nécessaire pour qu’il y ait un impact significatif sur les taux de maladie au Népal

Remerciements

Nous sommes reconnaissants envers tout le personnel et les patients de l’hôpital Patan, en particulier Mark Zimmerman, Umesh Shrestha, Dinesh Kumar BK, Rita Bajracharya, Nabaraj Dahal, Mark Steinhoff et Kurien Thomas, ainsi que le personnel de microbiologie du Christian Medical College Vellore. , Inde et collaborateurs du réseau Alliance Pneumococcique d’Asie du Sud Soutien financier PneumoADIP et l’Initiative Hib de l’Université Johns Hopkins, avec une subvention à l’Université d’Oxford PneumoADIP et l’Initiative Hib sont entièrement financés par l’Alliance GAVI et le Vaccine Fund; Cet article a été publié dans le cadre d’un supplément intitulé « Surveillance coordonnée et détection des infections pneumococciques et à Hib dans les pays en développement », parrainé par PneumoADIP de l’Alliance GAVI de l’école de santé publique Johns Hopkins Bloomberg, Baltimore, Maryland Conflits d’intérêts potentiels AJP agit en tant qu’investigateur principal pour les essais cliniques menés par les fabricants de vaccins, y compris les fabricants de vaccins antipneumococciques, mais ne reçoit aucun paiement personnel de leur part. les subventions pour l’organisation d’activités éducatives sont versées directement à un fonds éducatif / administratif détenu par le Département de pédiatrie, Université d’Oxford Tous les autres auteurs: pas de conflits